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특정 유전자배열을 가진 인물만을 죽음에 이르게하는 인공 레트로바이러스.
조지 시어즈 대통령의 지휘 아래, 리처드 에임즈가 암살 바이러스 프로젝트를 계획. ATGC사의 유전자 연구자 나오미 헌터를 중심으로 개발이 진행되었다. 나오미 헌터는 유전자특정 프로그램을 개발. 국방장관 짐 하우스먼의 명령에 의해 섀도우 모세스 섬 사건에 잡입하는 솔리드 스네이크를 벡터(운송자)로서 살포되었다. FOXHOUND를 죽이는 바이러스로 'FOXDIE'라 명명되었다. FOXDIE는 DDS 기술(Drug Delivery System, 체내환부에 직접약품의료를 하는 의료기술)을 베이스로 한 파이버 구조에 의해 형성되었다. 벡터의 체내에서 증식, 잠복한 FOXDIE는 공기를 매개로 하여 타겟에 감염. 감염한 FOXDIE는 체내 매크로파지의 조직을 사용하여 TNF E(입실론)을 만들기 시작한다. TNF E은 사이토카인의 일종으로 세포사를 유발하는 유발하는 펩티드. 매크로파지에 활성을 보이지 않으면 무해화하여 자연스럽게 배출된다. 활성화한 TNF E은 혈류를 타고 심장에 도달하여 심근세포의 리셉터와 결합한다. 자극을 받은 심근세포는 급격한 아포토시스를 일으킨다. 그리하여 심장마비와 형태로 타겟을 죽음에 이르게 한다.

섀도우 모세스 섬 사건에서 FOXDIE는 인질이 된 케네스 베이커, 리퀴드 스네이크를 시작으로 하는 FOXHOUND 멤버를 타겟으로 하고있었다. (도널드 앤더슨은 짐 하우스먼의 친구이며, 또한 섀도우 모세스 섬에서 연습 데이터를 가지고 돌아오는 역할이었기에 타겟에서 제외되어 있었다.)하지만 작전 직전에 나오미 헌터는 유전자특정 프로그램을 조작하여 타겟을 변경했다. 이 독단은 솔리드 스네이크에 개인적인 원한을 갖고있던것이 이유로 여거지나, 실제로 어떤 조작을 하였는지는 불명.섀도우 모세스 섬 사건에서 FOXDIE에 의한 사망을 확인할 수 있었던 것은 디코이 옥토퍼스, 케네스 베이커, 리퀴드 스네이크, 이 3명이다.

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